Я вообще считаю что правильнее всего (я имею ввиду комисию за переводы) сделано в WebMoney.
Комисию нужно брать с исходящего перевода (с того, кто отправляет деньги) а не с приходящего (с того, кто их получает)...
Вот, например, в WebMoney можно отправить 0.01 у.е. (1 цент), да ты при этом реально отправишь 2 цента, но получатель свой 1 цент получит... А в Liberty Reserve - попробуйте отправить кому-либо 1 цент, получатель ничего не получит (т.к. его съест комисия)...
Конечно же - это всё - лично моё мнение...